Il Laboratorio, per assicurare il miglioramento continuo della qualità e dell’affidabilità  dei risultati, applica un rigoroso programma giornaliero intra-laboratorio sul controllo statistico di qualità (CQI) dei risultati di laboratorio, utilizzando sieri di controllo.

Tutte le analisi i cui valori risultino al di fuori del range normale di riferimento, vengono sottoposte “di routine” a ripetizione, per conferma del risultato analitico.

Il Laboratorio partecipa sistematicamente a Programmi Nazionali di Valutazione Esterna della Qualità (VEQ) (Azienda Ospedaliero-Universitaria Careggi - Qualimedlab). Tali programmi consistono nell'esaminare campioni a titolo incognito inviati periodicamente dall'azienda che gestisce il VEQ ai laboratori partecipanti.

Questi si impegnano a inviare, nei tempi concordati, i risultati ottenuti all'azienda del VEQ. Quest'ultima,  ricevuti i risultati e dopo averli sottoposti a elaborazione statistica e a confronto con i risultati degli altri laboratori partecipanti al programma di VEQ, fornisce a ciascun laboratorio gli elaborati che lo riguardano.